Osmanlı ordusunu terk eden Ermeni gençleriyle Muş’takilerden müteşekkil isyan çeteleri 1915 Şubat’ında Müslüman ahaliye saldırdılar ve Osmanlı askerlerine karşı durdular. Muş’taki Arak Manastırı’nı ele geçiren Ermeni isyancıları, jandarma kumandanını ve birçok jandarma erini öldürdüler. Taşnaklar tarafından organize edilen yerli köylüler, dağınık halde bulunan jandarma güçlerine saldırıp, onları öldürdüler. Ermenilerle Kürtler arasında çıkan çatışmalarda, Ermenilerin daha iyi silahlara sahip olduğu ortaya çıktı. Müslüman ve Ermenilerden çok kayıplar oldu ve isyancılarla jandarma arasındaki çatışma Temmuz ayına kadar sürdü.
Askerler nihayet Muş ve çevresindeki isyancıları püskürtmeyi başardılar, ama bunun Osmanlı’nın cephe mücadelesine zararı yüksek oldu. Eğer Muş isyanı, Osmanlı’yı Doğu’da kaybetmek amacıyla yürütüldüyse, başarılı sayılır, çünkü onlarla mücadele etmek için yollanan askerler, Filistin cephesinden çekilmişlerdi.